厦门大学海洋考古学研究中心成立于2004年7月，是挂靠于厦门大学人文学院的校级科研机构。本中心秉承厦门大学人文历史研究面向中国东南与东南亚、面向海洋以及与文化人类学相结合的学术传统，主要从事海洋考古理论、水下考古技术、环中国海海洋文化遗产、华南与东南亚的海洋历史与文化、中国海疆与海洋国土的考古证据等相关研究，是国家海洋考古理论研究与水下考古实践协作的重要学术平台。近十年来，本中心研究人员先后在海洋考古学术领域承担了十多项包括国家社科基金重大项目、一般项目、青年项目、教育部人文社科重大项目等在内的科研项目，参与了辽宁、山东、福建、广东等沿海一系列沉船遗址的水下考古工作，出版《海洋遗产与考古》、《从百越土著到南岛海洋文化》、《涨海行舟—海洋遗产的考古与历史探索》、《中国东南海洋性瓷业的历史进程》、《沉船、瓷器与海上丝绸之路》、《海洋考古学》、《环中国海沉船》等著作，参与《辽宁绥中三道岗元代沉船》、《福建连江定海湾沉船考古》等报告的编写，对于促进海洋考古学术研究发挥了重要作用。

本中心不仅是全国高校中独具特色的人文学术研究机构，也是我国海洋考古人才培养和教学研究的重镇。目前已初步建成在国内高校首创的以中国东南沿海为中心的海洋考古学教学体系。在专业与学科总体发展方向上，形成包括东南沿海考古、岛屿考古、海港考古、沉船考古、海洋文化遗产、海洋文化史等多学科整合与文理交叉的东南海洋考古教学与科研系统。在教学与课程体系方面，建成包括本、硕、博、博士后在内的完整的海洋考古学教学与课程体系。在教材建设方面，形成一套完整的海洋考古教材与参考读物，填补了我国考古学学科建设中的一项重要空白。在实践教学与实验室建设方面，通过校内外、跨地域、多部门与文理协作，建成完善的海洋考古技术实验室和校外实习基地。本中心海洋考古教学团队长期参与承担国家水下考古专业人员培训班的理论教学任务，为我国海洋考古人才培养贡献力量。